GMIT Haumeni Nisum terletak di Desa Oemasi, Kecamatan Nekamese, yang dibangun pada tanggal 30 September 1956-1980. GMIT Haumeni Nisum merupakan wilayah pelayanan Klasis Kupang Barat. GMIT Haumeni Nisum pernah tergabung dalam Mata Jemaat Musafir Oepura, kemudian dengan Getsemani Sikumana pada tahun 1980-1984. Kemudian pada tahun 1990-1995, GMIT Haumeni Nisum bergabung dengan Jemaat Lopo Maus sebagai pusat pelayanan, dan beberapa Mata Jemaat yaitu Jemaat Hosana Oekona, Jemaat Oemathonis Noelsinas, dan Jemaat Betel Oeana. GMIT Haumeni Nisum menjadi Jemaat mandiri pada tahun 2013.