GMIT Betel Nitneo adalah Jemaat yang bernaung dalam Sinode GMIT dan Klasis Kupang Barat. Gedung kebaktian Jemaat Betel Nitneo terletak di Desa Nitneo, dan wilayah pelayanannya meliputi sebagian Desa Nitneo dan sebagian Desa Bolok. GMIT Betel Nitneo pada awalnya merupakan bagian dari Jemaat GMIT Elim Bolok. GMIT Betel Nitneo dalam pelayanan sebelumnya pernah bergabung dalam beberapa wilayah pelayanan seperti wilayah Foenenok, wilayah Manulai, wilayah Bolok, dan wilayah Kuanheun. GMIT Betel Nitneo menjadi Jemaat mandiri pada tahun 2014.